Mokėsi Gelvonų pradžios ir Žaslių vidurinėje mokykloje. Pirmąsias muzikos žinias gavo iš Žaslių bažnyčios vargonininko P. Utyros. [[1960]] -– [[1964]] choro dirigavimo mokėsi Vilniaus [[Juozas Tallat-Kelpša|J. Tallat-Kelpšos]] muzikos technikume (dėst. [[Elena Kriščiūnienė|E. Kriščiūnienė]]). [[1964]] -– [[1969]] neakivaizdiniu būdu choro dirigavimą studijavo [[Lietuvos Muzikos Akademija|Lietuvos valstybinėje konservatorijoje]] (dėst. V. Raupėnas).
[[1964]] -– [[1967]] muzikos ir dainavimo mokytoja, merginų choro ir vaikinų vokalinio ansamblio vadovė Rokiškio vidurinėje mokykloje. Tuo pačiu laiku vadovavo Rokiškio profsąjungų mišriajam chorui, kurį parengė [[1965]] respublikinei dainų šventei.
Nuo [[1967]] Rokiškio kultūros mokyklos choro dirigavimo ir kitų disciplinų dėstytoja, moksleivių choro studijos vadovė. Iš pradžių vadovavo merginų chorui, o [[1970]] -– [[1974]] mišriajam. Choras rengė valstybinių egzaminų programas, dalyvavo rajono ir respublikinėse dainų šventėse, koncertavo, prizinių vietų pelnė įvairiuose konkursuose. [[1969]] -– [[1971]] chorvedė vadovavo Rokiškio žemės ūkio mašinų vyrų chorui ir moterų vokaliniam ansambliui, konsultavo Pandėlio mišrųjį chorą -– su vyrų ir mišriuoju choru dalyvavo [[1970]] respublikinėje dainų šventėje. Daug metų dainavo Rokiškio kultūros mokyklos dėstytojų moterų vokaliniame kvartete, kuris [[1971]] respublikiniame „Sidabrinių balsų“ konkurse pelnė absoliučiai geriausio kolektyvo vardą. Kvartetas daug koncertavo savo rajone, dainavo [[Latvija|Latvijoje]], [[Baltarusija|Baltarusijoje]], dalyvavo televizijos laidose. [[1971]] -– [[1990]] vadovavo Rokiškio centrinės ligoninės moterų vokaliniams ansambliams, kurie taip pat koncertavo [[Lietuva|Lietuvoje]] ir [[Latvija|Latvijoje]], dalyvavo televizijos laidoje ir [[1976]] respublikiniame „Sidabrinių balsų" konkurse.
[[1991]] Rokiškio kultūros mokyklą perorganizavus į kolegiją (rengiami vargonininkai), joje dėsto (nuo [[1995]] vyr. dėstytoja) ir vadovauja mišriajam chorui, kuris koncertuoja, gieda bažnyčiose, dalyvavo [[1994]] I ir [[1998]] II Pasaulio lietuvių dainų šventėse [[Vilnius|Vilniuje]], [[1996]] giedojo [[Vilniaus Katedra|Vilniaus Arkikatedroje Bazilikoje]], dalyvauja Aukštaitijos zonos tradicinėse dainų šventėse Zarasuose ir kituose kultūros renginiuose.
J. Mikalajūnienė -– Rokiškio rajono dainų švenčių organizatorė, dirigentė ir vyr. dirigentė.
