Iki šiol nėra tvirtos nuomonės, kuriai genčiai ši rūšis priklausė, ir dažnai priklausomai nuo skirtingų autorių šaltinių, jis priskiriamas ''[[Carcharocles]]'', ''[[Megaselachus]]'', ''[[Otodus]]'' ir ''[[Procarcharodon]]'' gentims. Anksčiau buvo manyta, kad priklausė [[Silkiniai rykliai|silkinių ryklių]] (''Lamnidae'') šeimai ir buvo [[Didysis baltasis ryklys|didžiojo baltojo ryklio]] (''Carcharodon carcharias'') artimas giminaitis.
MilžinikasisMilžiniškasis megalodonas žinomas išskirtinai tik pagal fosilijų pavidalu rastus dantis. Tad nustatant šios rūšies dydį, kaip modeliu, anksčiau buvo remtasi tik šiuolaikiniu didžiuoju baltuoju rykliu (''Carcharodon carcharias''). Visgi remtis skirtingos šeimos vienu modeliu, anot mokslininkų, būtų netikslinga, tad kaip modelius mokslininkai pasirinko penkias ryklių rūšis – didįjį baltąjį ryklį (''Carcharodon carcharias''), [[atlantinis pilkšvasis ryklys|atlantinį pilkšvąjį ryklį]] (''Isurus oxyrinchus''), [[ilgapelekis pilkšvasis ryklys|ilgapelekį pilkšvąjį ryklį]] (''Isurus paucus''), [[lašišinis ryklys|lašišinį ryklį]] (''Lamna ditropis'') ir [[atlantinis silkiaryklis|atlantinį silkiaryklį]] (''Lamna nasus''). Taip buvo nustatyti milžiniškojo megadolono kūno matmenys. Jo maksimalus kūno ilgis iki 16 m, galva apie 4,65 m ilgio, nugaros pelekas apie 1,62 m aukščio, uodega apie 3,85 m aukščio. Vis dėlto kaip modeliu remiantis tik didžiuoju baltuoju rykliu, milžiniškojo megalodono kūno maksimalus ilgis galėjo būti nuo apie 15 m iki 18 m. Maksimalaus kūno ilgio milžiniškieji megalodonai buvo reti.
