Žmogui giminingiausi [[primatai]] yra [[šimpanzė]]s, kiek mažiau – [[gorila|gorilos]], [[orangutanas|orangutanai]] ir [[gibonas|gibonai]]. Žmogui taip pat giminingos pora medžiuose gyvenančių sklandūnų rūšių ([[kaguaniniai]]), taip pat priskiramų ''Primatomorpha'' grupei. <ref name="Janeckaetal2007">{{cite journal | author = Jan E. Janecka, Webb Miller, Thomas H. Pringle, Frank Wiens, Annette Zitzmann, Kristofer M. Helgen, Mark S. Springer, William J. Murphy | year = 2007 | title = Molecular and Genomic Data Identify the Closest Living Relative of Primates | journal = Science | volume = 318 | issue = 5851 | pages = 792–794 | doi = 10.1126/science.1147555 | pmid = 17975064 | bibcode=2007Sci...318..792J}}</ref> Pagal genomą žmogui dar gana artimi, nors jau daug mažiau, kiškiniai bei graužikai:
{{Clade
| label1=[[Euarchontoglires]]
| 1={{Clade
| label1=[[Glires]]
| 1={{Clade
| 1=[[Graužikai]]
| 2=[[Kiškiniai]]}}
| label2=[[Euarchonta]]
| 2={{Clade
| 1=[[Treeshrew|Scandentia]]
| label2=[[Primatomorpha]]
| 2={{Clade
| 1=[[Kaguaniniai]]
| 2={{Clade
| 1=†[[Plesiadapiformes]]
| 2=[[Primatai]] (ir žmogus)}} }} }} }}
}}
Maždaug prieš 4-8 milijonus metų ([[Miocenas|mioceno]] epochoje) susijungė dvi chromosomos, suformuodamos žmogaus chromosomą 2. Taip žmogaus genomas atsiskyrė nuo jam artimiausio šimpanzės genomo, kuriame yra viena chromosomų pora daugiau. <ref>Ruvolo, M. 1997. Genetic Diversity in Hominoid Primates. Annual Review of Anthropology , Vol. 26, (1997), pp. 515–40</ref><ref name=Ruvolo1997>{{cite journal |author=Ruvolo, Maryellen |title=Molecular phylogeny of the hominoids: inferences from multiple independent DNA sequence data sets |url=http://mbe.oxfordjournals.org/cgi/reprint/14/3/248 |journal=Molecular Biology and Evolution |volume=14 |issue=3 |pages=248–65 |year=1997 |pmid=9066793 |doi=10.1093/oxfordjournals.molbev.a025761}}</ref>
