Didžiausi istorinės Dzūkijos miestai yra [[Gardinas]], [[Lyda]], [[Suvalkai]] (nors jis priskiriamas Suvalkijai[[Suvalkai#GeografijaSuvalkija| 1Suvalkijai]]) ir [[Alytus]],– pastarasis dažnai pavadinamas „Dzūkijos sostine“, bet dab. Dzūkijos istorinio prototipo (iki [[1413]] m. gyvavusios Trakų kunigaikštystės) politinio centro funkcijas visuomet atlikdavo kita gyvenvietė (iš pradžių – tikriausiai [[Merkinė]], kuri bent iki XV a. buvo pusę Trakų kunigaikštystės apėmusios ''Merkinės žemės'' centras, nuo XIII a. pab. (?) – [[Senieji Trakai]], nuo XIV a. 8 dešimtmečio – [[Trakai]]).