Izabelė gimė [[Krokuva|Krokuvoje]], ji buvo vyriausioji karaliaus [[Žygimantas Senasis|Žygimanto Senojo]] ir jo italės žmonės [[Bona Sforza|Bonos Sforzos]] šeimoje. Didžiąją dalį savo vaikystės praleido [[Vavelis|Vavelio pilyje]] ir medžioklės pilyje Niepolomicėje. 1527-29 ir 1533-36 m. gyveno Lietuvoje. Pastarojo vizito metu jos trys jaunesniosios seserys liko Krokuvoje. Bona Sforza daugiau dėmesio skyrė vyresniajai dukteriai, anksti ją ištekino, o kitomis trijomis jos seserimis mažai rūpinosi ir jos ištekėjo vėlai. Izabelė gavo gerą išsilavinimą, galėjo kalbėti ir rašyti keturiomis kalbomis: lenkų, lotynų, vokiečių ir italų (motinos gimtąja kalba).