Nukleosoma: Skirtumas tarp puslapio versijų

Ištrintas turinys Pridėtas turinys
Zygimantus (aptarimas | indėlis)
Felicilijonas (aptarimas | indėlis)
Eilutė 1:
[[Vaizdas:H_DNR_komplekso_formavimasis.png|thumb|300px|Histonų susirinkimas į nukleosomą]]
[[Vaizdas:H_DNR_kompleksas.png|thumb|200px|Histonų  – [[DNR]] kompleksas]]
'''Nukleosoma'''  – pagrindinis [[chromatinas|chromatino]] struktūrinis ir reguliacinis elementas, sudarytas iš [[histonas|histonų]] oktamero šerdies ir aplink ją apsivijusios apie 200 [[nukleotidas|nukleotidų]] ilgio [[DNR]] grandinės. Šios struktūros [[evoliucija|evoliucijos]] požiūriu yra labai konservatyvios ir randamos visų [[eukariotas|eukariotų]] chromatine. Pagrindiniai nukleosomos organizacijos principai, t. y. tai, jog nukleosomos šerdį sudaro [[baltymas|baltymų]] histonų oktameras, kuris tam tikru būdu sąveikauja su DNR, buvo pasiūlyti dar 1974 metais A. [[Kornbergas|Kornbergo]], remiantis histonų savybėmis:
* Nukleosomos histoninę šerdį sudaro po dvi keturių rūšių histonų molekules: '''H2A''', '''H2B''', '''H3''' ir '''H4''';
* Baltymų histonų [[masė]] yra lygi DNR masei, histonų oktameras sąveikauja su maždaug 200 nukleotidų porų DNR;
Eilutė 7:
* Su viena nukleosoma chromatine sąveikauja maždaug viena histono '''H1''' [[molekulė]], nes šio tipo histonų masė chromatine sudaro apie pusę kiekvieno tetramerą sudarančio histono masės.
 
Nukleosomos aptinkamos [[mitozė]]s ir [[interfazė]]s stadijose, [[euchromatinas|euchromatine]] ir [[heterochromatinas|heterochromatine]]. Nukleosoma  – tai pirmoji DNR kondensacijos pakopa. DNR organizuota į nukleosomas, lyginant su „nuoga“ DNR, yra maždaug 4-6 kartus labiau kondensuota. Didžiausias DNR kondensacijos laipsnis (10-100 000 kartų) pasiekiamas per keletą tarpinių struktūrų. [[In vitro|''In vitro'']] geriausiai ištirtos yra dvi struktūros  – 10 nm [[chromatino fibrilė]] ir 30 nm chromatino fibrilė  – [[solenoidas]]. Didesnį DNR „supakavimo“ laipsnį atitinkančių chromatino struktūrų (chromatino kilpų bei mitozinių [[chromosoma|chromosomų]]) organizacija dar nėra gerai ištirta.
 
Chromatino struktūrinės organizacijos eukariotų [[Ląstelės branduolys|branduolyje]] yra šios:
# „Nuoga“ DNR (kondensacijos laipsnis (k.l.)  – 1<sup>*</sup>)
# 10 nm chromatino fibrilė (k.l.  – 6-7<sup>*</sup>)
# 30 nm chromatino fibrilė  – solenoidas (k. l.  – 30-40<sup>*</sup>)
# Chromatino kilpa (k.l.  – 1000<sup>*</sup>)
# Mitozinė chromosoma (k.l.  – 10000-100000<sup>*</sup>)
, kur <sup>*</sup> kondensacijos laipsnis, nurodantis, kiek μm DNR telpa į vieną atitinkamos struktūros ilgio μm
 
Galimas ir kitoks chromatino struktūrinės organizacijos skirstymas  – skirstymas į lygius:
* ''Pirmasis chromatino lygis'' - – nukleosomos grandinėlėje;
* ''Antrasis chromatino lygis'' - – tarpusavyje sąveikaujančios nukleosomos (pvz., 30 nm chromatino fibrilė);
* ''Trečiasis chromatino lygis'' - – tarpusavyje sąveikaujančios antrinio lygio struktūros.
 
== Molekulinė nukleosomos organizacija ==
 
Nukleosomas galima stebėti suardžius ląstelių branduolius ir [[ekstraktas|ekstraktą]] [[inkubacija|inkubuojant]] nedidelės [[joninė jėga|joninės jėgos]] tirpale. Chromatinas išbrinksta ir kai kur išsivynioja į siūlo pavidalo struktūrą, kurioje [[elektroninis mikroskopas|EM]] galima įžiūrėti atskiras nukleosomines daleles, tarpusavyje sujungtas DNR grandinėle. Tokį dekondensuotą chromatiną paveikus mikrokokų [[nukleazė|nukleaze]], fermentu skaldančiu DNR grandinę tik „nuogoje“ jos formoje, gaunamos pavienės nukleosomos. Tokių nukleosomų sudėtyje yra visi penki histonų baltymai (H1, H2A, H2B, H3 ir H4) bei apie 200 bp ilgio DNR grandinė. Ilgiau veikiant mikrokokų nukleaze DNR grandinė sutrumpėja iki 165 bp  – tai nukleosoma, į kurios sudėtį vis dar įeina H1 baltymas. Po ilgesnės nukleosominių dalelių inkubacijos su mikrokokų nukleaze, H1 histono nebelieka asocijuoto su nukleosoma ir DNR grandinėlė sutrumpėja iki 146 bp. Tokia dalelė yra vadinama ''šerdine nukleosomine dalele''.
 
[[Kategorija:Biochemija]]