Gyvenvietė minima nuo XVII amžiaus. [[1639]] m. dvarnininkasdvarinininkas [[Jonas Klockis]] Pivašiūnų žemes padovanojo [[Senieji Trakai|Senųjų Trakų]] [[benediktinai|benediktinų]] vienuolynui. [[1648]] m. [[Medilas|Medilo]] seniūnas pastatydino bažnyčią, tapusią Trakų bažnyčios filija. Fundatorius pavedė bažnyčią Trakų vienuoliams [[benediktinai|benediktinams]], kurie čia gyveno iki [[1831 sukilimas|1831 m. sukilimo]]. Dvi pirmosios Pivašiūnų bažnyčios stovėjo įkalnėje, bet sudegė. [[1825]] m. parapijos klebonas [[Celestinas Soroka]] ant kalvos (aukščiausia miestelio vieta) pastatė naują klasicizmo stiliaus bažnyčią mūrinėmis kolonomis.
[[2006]] m. patvirtintas [[Pivašiūnų herbas]]. Kaimą smarkiai nusiaubė [[2010 m. rugpjūčio 8 d. škvalas]] – nukentėjo šventorius, gatvės, [[Pivašiūnų piliakalnis]].
