Kaukazo aviganiai yra viena iš seniausių ir archaiškiausių žinomų molosinio tipo šunų veislųveislių. Pirmieji šio tipo šunys atsirado [[Tibetas|Tibete]]. Tai buvo labai stambūs bei pikti šunys, kurie išimtinai gynė savo šeimininkus, teritoriją bei gyvulių bandas. Pirmasis žinomas rašytinis šaltinis yra datuojamas [[1121]] m. pr. m. e., kai toks šuo buvo padovanotas [[Kinija|Kinijos]] imperatoriui. Vėliau šie šunys, keliaudami kartu su savo klajokliais šeimininkais, atsidūrė [[Azerbaidžanas|Azerbaidžano]], [[Kazachstanas|Kazachstano]] stepėse, [[Gruzija|Gruzijos]] ir [[Armėnija|Armėnijos]] kalnuose bei priekalnėse. Šiomis sąlygomis susiformavo du Kaukazo aviganio, kaip veislės, tipai: kalnų ir lygumų. Kalnų tipo aviganis buvo ir yra raumeningesnis, stambesnis, ilgesnio plauko [[Kailis|kailiu]], trumpesnėmis kojomis nei lygumų tipo šuo. Lyguminis kaukazo aviganis truputį trumpesnio plauko, ilgesnių kojų bei lieknesnio sudėjimo. Maždaug [[II amžius|II]]-[[III amžius|III]] a. pr. m. e. šie šunys, dalyvaudami įvairiuose karo žygiuose kaip koviniai šunys, pateko ir į Europą, kur tapo daugelio stambių [[Europa|Europos]] šunų veislių protėviais. Dabartiniai Kaukazo aviganiai yra planinio veisimo rezultatas. Šios veislės šunims buvo pagerintas jų charakteris ir sarginės savybės, nors kartais dar prasiveržia [[instinktas]] pulti kitą gyvūną.
