- Alšėnai, k.
- Armaniškiai, k.
- Bijūnai, k.
- Bliovai, k.
- Čebeliškė, k.
- Dievogala, k.
- Digriai, k.
- Girininkai I, k.
- Girininkai II, k.
- Jonučiai, k.
- Kampiškiai, k.
- Kūjagalviai, k.
- Macijauskai, k.
- Mastaičiai, k.
- Narsiečiai, k.
- Naugardiškė, k.
- Pabartupis, k.
- Padainupys, k.
- Pamaišupys, k.
- Pažėrai, k.
- Poderiškiai, k.
- Smailiai, k.
- Stanaičiai, k.
- Šilėnai, k.
- Šniūrai, k.
- Tirkiliškiai, k.
- Tumpai, k.
- Antagynė, k.
- Antagynėlės, k.
- Babtai, k.
- Babtai, mstl.
- Baltriškė, k.
- Berlainiai, k.
- Cinkiškiai, k.
- Dasiūnai, k.
- Eglynai, k.
- Gailiušiai, k.
- Gaižuvėlė, k.
- Janušoniai, k.
- Jugintai, k.
- Juodoniai, k.
- Kačergiai, k.
- Kaniūkai, k.
- Karalgiris, k.
- Kikoniai, k.
- Krivėnai, k.
- Lazdynė, k.
- Muniškiai, k.
- Naujasodžiai, k.
- Naujatriobiai, k.
- Pagynė, k.
- Pakapiai, k.
- Panevėžiukas, k.
- Pavejuonis, k.
- Piepaliai, k.
- Selverava, k.
- Sitkūnai, k.
- Stabaunyčius, k.
- Šašiai, k.
- Urnėžiai, k.
- Vareikoniai, k.
- Vikūnai, k.
- Vilkėnai, k.
- Vosiškiai, k.
- Zacišius, k.
- Žemaitkiemis, k.
- Batniava, k.
- Beiniūnai, k.
- Brūžė, k.
- Bubiai, k.
- Dulkiai, k.
- Gineitai, k.
- Kriemala, k.
- Kvesai, k.
- Mozūriškiai, k.
- Naujiena, k.
- Paštuva, k.
- Ručkūnai, k.
- Rupunioniai, k.
- Tirkšliai, k.
- Tolivardžiai, k.
- Virbaliūnai, k.
- Žėbiškiai, k.
- Žvirgždė, k.
- Antkalniai, k.
- Besmerčiai, k.
- Čekiškė, mstl.
- Dokeliai, k.
- Dokiai, k.
- Eikščiai, k.
- Gaigalai, k.
- Gegužėnai, k.
- Juškaičiai, k.
- Kairiai, k.
- Karalgiris, k.
- Kilova, k.
- Lebedžiai, k.
- Lelerviškiai, k.
- Lipikiškiai, k.
- Liučiūnai, k.
- Mikliūnai, k.
- Mikniava, k.
- Miškalaukis, k.
- Padubysys, k.
- Pagiriai, k.
- Paprieniai, k.
- Prienai, k.
- Purvaičiai, k.
- Radviliškiai, k.
- Ramonai, k.
- Raudonė, k.
- Severinava, k.
- Teklinava, k.
- Uždulinskiai, k.
- Audėjai, k.
- Domeikava, k.
- Eigirgala, k.
- Kumpiai, k.
- Radikiai, k.
- Ražiai, k.
- Romaškiai, k.
- Saliai, k.
- Smiltynai I, k.
- Šakiai, k.
- Varluva, k.
- Vytėnai, k.
- Voškoniai, k.
- Žemaitkiemis, k.
- Bagniškė, k.
- Budriai, k.
- Garančiškė, k.
- Grabava, k.
- Ilgakiemis, k.
- Ireniškiai, k.
- Jonučiai II, k.
- Juragiai, k.
- Juraitiškė, k.
- Jurginiškiai, k.
- Kalinava, k.
- Karkazai, k.
- Naugardiškė, k.
- Pagiriai, k.
- Pajiesys, k.
- Rašnava, k.
- Ražiškiai, k.
- Rinkūnai, k.
- Seniava, k.
- Sprindiškės, k.
- Stanaičiai, k.
- Teleičiai, k.
- Tvarkiškiai, k.
- Biruliškės, k.
- Karmėlava, mstl.
- Karmėlava II, k.
- Kaukazas, k.
- Margava, k.
- Martinava, k.
- Narėpai, k.
- Naujasodis, k.
- Peleniai, k.
- Ramučiai, k.
- Rykštynė, k.
- Sergeičikai I, k.
- Sergeičikai II, k.
- Vaistariškiai, k.
- Andruškoniai, k.
- Barsūniškiai, k.
- Didžiosios Lapės, k.
- Drąseikiai, k.
- Ginėnai, k.
- Lapės, mstl.
- Lepšiškiai, k.
- Masteikiai, k.
- Pakalniškiai, k.
- Rokiškiai, k.
- Smiltynai II, k.
- Stavidvaris, k.
- Staviščiai, k.
- Šančiai, k.
- Šatijai, k.
- Tauralaukis, k.
- Bernatoniai, k.
- Biliūnai, k.
- Didvyriai, k.
- Dūminas, k.
- Godėnai, k.
- Kačiūniškė, k.
- Kalnyčiai, k.
- Karnavė, k.
- Lomanka, k.
- Lukšakaimis, k.
- Maksva, k.
- Miškiniai, k.
- Naujatriobiai, k.
- Naujieji Bernatoniai, k.
- Netoniai, k.
- Raudondvaris, k.
- Senieji Bernatoniai, k.
- Šilelis, k.
- Upytė, k.
- Armaniškiai, k.
- Bajorai, k.
- Čebeliškė, k.
- Gaižėnai, k.
- Gaižėnėliai, k.
- Girininkai II, k.
- Karkiškės, k.
- Kazliškiai, k.
- Kuodiškiai, k.
- Luobinė, k.
- Miriniškiai, k.
- Mitkūnai, k.
- Noreikiškės, k.
- Pypliai, k.
- Poderiškiai, k.
- Ringaudai, k.
- Sakalai, k.
- Tabariškiai, k.
- Virbališkiai, k.
- Dankstytė, k.
- Girininkai, k.
- Kairiūkščiai, k.
- Pamoterys, k.
- Paraželiai, k.
- Patamulšėlis, k.
- Pavytė, k.
- Raželiai, k.
- Rokai, k.
- Rokeliai, k.
- Rokų Miško Kelmynas, k.
- Vainatrakis, k.
- Vaišvydava, k.
- Vingytė, k.
- Arlaviškės, k.
- Dobilija, k.
- Guogai, k.
- Leonavas, k.
- Margininkai, k.
- Piliuona, k.
- Sietynas, k.
- Taurakiemis, k.
- Tursonas, k.
- Užupiai, k.
- Vainatrakis, k.
- Vyčius, k.
- Viršužiglis, k.
- Bivyliai, k.
- Giraitė, k.
- Kudrėnai, k.
- Linkuva, k.
- Naujieji Muniškiai, k.
- Paltiškiai, k.
- Paparčiai, k.
- Romainiai, k.
- Romainių Kaimelė, k.
- Sausinė, k.
- Užliedžiai, k.
- Vijūkai, k.
- Žemaitkiemis, k.
- Ąžuolynas, k.
- Bitvanas, k.
- Boniškiai, k.
- Butkūnai, k.
- Didieji Ibėnai, k.
- Galulaukė, k.
- Geranoniai, k.
- Jackiškiai, k.
- Juozapava, k.
- Karaliūnai, k.
- Kazimierava, k.
- Kėkštynė, k.
- Mažieji Ibėnai, k.
- Mėkla, k.
- Padaugupis, k.
- Pagiriai, k.
- Pociūnai, k.
- Preišiogala, k.
- Puikoniai, k.
- Rokiškis, k.
- Skrebiniškiai, k.
- Stankūnai, k.
- Užumiškiai, k.
- Valerava, k.
- Vandžiogala, mstl.
- Vigiai, k.
- Vimbarai, k.
- Adomkiškiai, k.
- Akuotai, k.
- Antalkiai, k.
- Aukštkalniai, k.
- Baravai, k.
- Bernoriškiai, k.
- Buivydai, k.
- Daučioniai, k.
- Daugeliškiai, k.
- Daugužiai, k.
- Gaideliškiai, k.
- Gailiūnai, k.
- Gineikiai, k.
- Godėnai, k.
- Gudravis, k.
- Jagminiškiai, k.
- Jaučakiai, k.
- Jokavai, k.
- Jotautai, k.
- Juodžiai, k.
- Juozapava, k.
- Krūvandai, k.
- Lauksvydai, k.
- Lazduoniai, k.
- Liepdvarys, k.
- Lygainiai, k.
- Pabaliai, k.
- Padauguva, k.
- Padauguvėlė, k.
- Padubysys, k.
- Palazduonys, k.
- Paprūdžiai, k.
- Partikai, k.
- Pastriūnys, k.
- Pašiliai, k.
- Purviškiai, k.
- Raubatoniai, k.
- Ringovė, k.
- Ručkoniai, k.
- Saulėtekiai, k.
- Skrebenai, k.
- Stanislava, k.
- Šoliai, k.
- Vaitkūnai, k.
- Valmantiškiai, k.
- Vilkija, k.
- Zauniškiai, k.
- Žėbiškėliai, k.
- Žėbiškiai, k.
- Altoniškiai, k.
- Braziūkai, k.
- Dievogala, k.
- Durpynas, k.
- Jadagoniai, k.
- Judraičiai, k.
- Kluoniškiai, k.
- Krušinskai, k.
- Kuodiškiai, k.
- Kuras, k.
- Nova, k.
- Papiškiai, k.
- Riogliškiai, k.
- Rupinai, k.
- Šiuliai, k.
- Vilemai, k.
- Vincentavas, k.
- Zapyškis, mstl.
- Zizai, k.
2001 m. gyventojų surašymas